안녕하세요.
회사업무에 관련한 질문이라 민망하고 또 이런 질문 드려도 될지 모르겠지만..
어디 물어보기도 뭐하고 하여 질문을 드립니다.

제가 이번에 입사한 회사는 조그만한 회사인데요.
이전에 있던 담당자가 회사 퇴직금과 중도정산 금액에 대해 주던 방식이
퇴직금은 바로 주고, 중도정산 금액에 있어서 연말정산이 끝나고 지급하는 식으로 했다는 겁니다.
(퇴직신청 및 원천세 신고는 모두 끝나있는 상황입니다. 다만 퇴직자에게 돈 지급을 안했을 뿐입니다.)

그래서 그동안 퇴직했던 사람들의 중도정산 금액을 지급을 안하고 있다가
이번에 연말정산 끝나고 하나둘씩 갑자기 전화가 와서 중도정산 돈을 안줬다 하면서 연락이 왔습니다.

안준 돈이니 줘야 하는게 맞죠.
사실 경영진이 물갈이가 된터라 이런 상황에 모르고 있었던 터라, 이러이러하게 되었다 라 말하니 돈을 줘라 지시가 내려왔습니다.
그래서 근로소득원천영수증을 뽑고 지급에 대해 결제를 맡으려 하는데
윗선에서 영수증을 보면서
"중도퇴사를 하는데 근로소득영수증에 부양가족에 대한 공제가 도대체 왜 들어가느냐" 라시는군요.
저희 회사는 더존프로그램을 쓰는데, 사원등록에 되어있는 부양가족으로
연말정산 식으로 부양가족 공제가 자동으로 들어간 것입니다.

윗선에서는 "중도퇴사에 대한 금액은 부양가족공제를 하지 않는 것이 맞다." 라 하시며
사원 등록에 있는 부양가족 내용을 지우라 하셨습니다.

음.. 그래서 퇴사자들의 사원등록에 되어있던 부양가족을 싹 다 지웠습니다.

그랬더니 당연히 결정세액이 변화하였죠. 심지어 환급을 해줘야 하는 사람이 납부를 해야 하는 상황도 왔습니다.
퇴사를 했는데, 납부도 해야하나? 라는 질문이 머리속에 들었지만 그건 그렇다 치고
이런경우에 회사에서 어떤 행동을 해야 하는가 가 궁금해 진 것입니다.

질문은 다음과 같습니다.

1. 부양가족을 지운게 맞는 상황인가?
    중도퇴사자 연말정산은 전직장이 해주는게 아니긴 한데.. 도대체 근로소득영수증엔 왜 부양가족 공제가 뜨는거였는지..

2. 회사는 퇴사한 사원들에게 세금을 납부받아야 하는가?
     퇴사한 사원들이 세금 토해내야 한다고 해서 회사에 납부를 과연 할까요?

3. 회사는 환급이 아닌 납부에 대한 소득세 신고를 해야 하는가?
     환급이야 퇴직자들에게 회사가 해주는 거니까, 소득세 신고를 해야하는게 맞는데,
     2번에 의거, 납부를 받지 못한다면, 소득세 변경을 하지 않고, 영수증을 퇴사자에게 보내 5월 종합소득세 신고를
     스스로 하라고 해야 맞는건가 싶은데요.


... 아무튼 이러한 상황에 봉착하여 있습니다..
세무서에 물어보자니.. 긁어부스럼 되는건 아닐까 싶어 문의하기 꺼려지는게 사실이구요..
... 이런 쌩뚱맞은 질문을 하게 되서 저도 죄송합니다만.. 어떻게 해야할지 답변을 해주신다면 참 고맙겠습니다..

회계나 경리 쪽에 잘 아시는 분이 이글을 읽어주신다면.. 꼭 답변을 해주시면 감사하겠습니다.ㅠ
항상 좋은시간 되시길 바랍니다. ㅠ